たこぜりー研究室

大腸菌DNAは4.64Mbp。酵母は13Mbpで、ヒトは3Gbp

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卒業研究 #2

#413
前回 : 卒業研究 #1

まずは大量のコード配列 (coding sequence : CDS) を読み込むとする。

この練習があるから、fasta 形式はらくちんのはず。

>name description
sequence
;comments

System.IO.StreamReader で一行ずつ読んで、> で始まる行が来るまでループ。
それがきたら、">" or " " で区切る。
次の行から、再び > がくるまで配列として読み込み続ける。

あとはどうやって配列を保持するかだが…
最初っから三つ組でやろうとしてみたが、失敗するので却下。
やっぱり System.Collections.Generics.List<char> で。
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