たこぜりー研究室

大腸菌DNAは4.64Mbp。酵母は13Mbpで、ヒトは3Gbp

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卒業研究 #9

#420
LINQ を使わないで書くとどうなるだろう、と思って一応やってみた。
そしたら案外あっさりかけた。

もちろん匿名型は使えないので、自分で書く。
でその型のインスタンスを各々つくってリストに叩き込む。

そのときに同時に置換数も数える。
同義置換の場合にアミノ酸ごとの置換数をカウントし、辞書に入れておく。
あとは System.Collections.List<T>.Sort(System.Comparison<T>) で処理。

パフォーマンスの差がでるかどうかは不明。
VS2008 のほうは Beta2 ということもあるし。

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